氧化亚铁硫杆菌
微生物氧化预处理金矿石所用的细菌是以氧化亚铁硫杆菌(T. f 菌) 为主，还有氧化硫硫杆菌(简称T. t 菌) 和氧化亚铁钩端螺旋菌(Leptospirillum ferrooxidans) 等，它们都是无机化能自养菌。这些细菌是以CO2作为合成细菌的唯一或主要碳源，通过氧化矿物中的硫和亚铁来获得能量。
氧化亚铁硫杆菌是一种革兰氏阴性菌，具有化能自养、好气、嗜酸、适于中温环境等特性，广泛存在于酸性矿山水及含铁或硫的酸性环境中。氧化亚铁硫杆菌能产生三价铁离子，属于铁细菌的一种。它们能加速亚铁离子的氧化，但需要非常特殊的环境（如适当的pH值、温度、氧溶剂等等）。
氧化硫硫杆菌1922年由Waksman和Joffe分离得到，具有快速氧化单质硫以及还原态的硫化物的功能。是一种严格好氧的专性自养化能无机营养细菌。氧化硫硫杆菌缺乏EMP、ED途径以及TCA循环中的关键酶—磷酸果糖激酶、6-磷酸葡萄糖酸脱水酶、特征性酶2-酮-3-脱氧-6-磷酸葡萄糖酸醛缩酶以及α-酮戊二酸脱氢酶等，不能以有机质作为能源和碳源。只能通过固定CO2获得碳源，从无机物的氧化获得能源，而无机物的氧化还原电位较高，可供这些细菌生长利用的能量很少，所以这类细菌往往生长缓慢，代时长，细胞得率低。
氧化亚铁钩端螺旋菌(Leptospirillumferrooxidans)是生物湿法冶金过程主要的浸矿菌种之一。该菌是一类专性自养铁氧化细菌，螺旋状，革兰氏阴性菌，有鞭毛，可运动。最适生长pH 2.0，在pH 1.0时仍能很好的生长；最适生长温度37℃，最高45℃。由于L．ferrooxidans可以耐受较低的pH值及较高的氧化还原电位和较高的温度，因而在微生物浸矿中起着重要的作用，已越来越受到人们的关注。